Misją wydawnictwa jest opracowywanie i wydawanie książek naukowych i popularnonaukowych poświęconych Gdańskowi. Upowszechnia w ten sposób historyczne i kulturowe dziedzictwo miasta wzmacniając tożsamość współczesnych gdańszczan.
W obszarze zainteresowań Wydawnictwa znajdują się dyscypliny humanistyczne i społeczne z historią, archeologią, historią sztuki, architekturą i socjologią na czele. Szukamy idealnego sposobu opisania różnorodności i fenomenu naszego miasta, dbając o wysoki poziom merytoryczny i edytorski. Chcemy zachować pamięć o jego przeszłości: o ludziach, zabytkach i ideach. Naszą myślą przewodnią jest zrozumieć Gdańsk i siebie samych – współczesnych mieszkańców Gdańska.
W naszym dorobku mamy monografie naukowe będące wynikiem długoletnich studiów, wydawnictwa źródłowe, ale też przewodniki i katalogi wystaw organizowanych w Muzeum Gdańska; wreszcie wspomnienia gdańszczan i książki dla dzieci popularyzujące historię naszego miasta.
Nad jakością naszych publikacji czuwa Kolegium Wydawnicze i Rada Naukowa, skupiająca wybitnych znawców dziejów i kultury Gdańska.